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ubuntu配置R語言環(huán)境-創(chuàng)新互聯(lián)

  1. ubuntu進不去root,貌似是每次開機時默認root密碼都會產(chǎn)生一個新的。

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 使用sudo passwrd重置root密碼

2. apt-get install r-base

3. apt-get  install  r-base-dev

4. 安裝成功。

ubuntu 配置R語言環(huán)境

5. 安裝Rstudio

ubuntu 配置R語言環(huán)境

下載安裝包安裝

下載 R-3.2.2.tar.gz

解壓:

  1. tar

    -zvxf

    R-2.13.0.tar.gz

配置:

  1. cd

    R-2.13.0

  2. ./configure

    --prefix=/home/xxx/R

    --enable-R-shlib

prefix設置R的安裝路徑,enable-R-shlib可以保證lib目錄下的動態(tài)庫能夠共享

如果提示G77錯誤

  1. sudo

    apt-get

    install

    build-essential

  2. sudo

    apt-get

    install

    gfortran

如果提示錯誤:configure:error:--with-readline=yes(default)...

  1. sudo

    apt-get

    install

    libreadline6-dev

如果提示錯誤:configure:error:--with-x=yes(default) and X11...

  1. sudo

    apt-get

    install

    libxt-dev

安裝:

  1. make

  2. make

    install

link到bin目錄下:

  1. cd

    /bin

  2. sudo

    ln

    -sv

    /home/xxx/R/bin/R

至此安裝完畢。

------------------------------------------------------

安裝pkg:

終端下輸入:R

  1. source("http://www.bioconductor.org/biocLite.R")

  2. biocLite()

默認將安裝一下幾個包

affy affydata affyPLM

annaffy annotate Biobase

Biostrings DynDoc gcrma

genefilter geneplotter hgu95av2

limma marray matchprobes

multtest ROC vsn

xtable affyQCReport

如果需要Bioconductor上別的包的話,可以使用

biocLite(c("pkg1", "pkg2"))

如:

  1. biocLite(c("copula",

    "pspline"))

安裝CRAN上的包

  1. install.packages(c("pkg1",

    "pkg2"))

來安裝(pkg1和pkg2為需要安裝的包)。
------------------------------------------------------

編輯器:

1.直接shell。終端輸入R,就進入R命令行了。

2.安裝GUI:Rcmdr

  1. sudo

    apt-get

    install

    r-cran-rodbc

  2. sudo

    apt-get

    install

    r-cran-rcmdr

運行R后,library(Rcmdr)就可以打開圖形界面。

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網(wǎng)頁題目:ubuntu配置R語言環(huán)境-創(chuàng)新互聯(lián)
網(wǎng)站路徑:http://www.aaarwkj.com/article2/gcsoc.html

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